ANR Fish-and-Chap : Regard sur l'autophagiemédiée par les chaperones chez les poissons

L’Autophagie médiée par les chaperonnes (ou CMA pour Chaperone-Mediated Autophagy) est une voie majeure du catabolisme lysosomal. Selon l’idée actuellement admise, cette fonction cellulaire n’existerait que chez les mammifères ou les oiseaux, qui seraient les seuls à exprimer LAMP2A, une protéine nécessaire au fonctionnement de la CMA. Or, nous avons récemment mis en évidence l’existence de LAMP2A chez un certain nombre d’espèces de poissons, remettant ainsi en question ce point de vue.

Enjeux et Objectifs

Dans ce contexte, nous proposons de définir pour la première fois si l’apparition de cette fonction est antérieure à celle des mammifères et des oiseaux, et de déterminer le rôle physiologique de l’homologue de la protéine LAMP2A identifiée chez les poissons. Notre stratégie repose sur deux approches complémentaires. La première, consistera à caractériser le répertoire et l'expression des gènes impliqués dans la CMA chez un grand nombre d'espèces de poissons d'intérêt agronomique, écologique et scientifique. Le nombre croissant d’espèces de poissons dont le génome est entièrement séquencé et disponible ainsi que les progrès récents dans l’analyse du transcriptome permettent aujourd’hui d’inclure dans l’étude un grand nombre d’espèces de poissons. Ce premier axe permettra ainsi d’avoir une vision précise de l’étendue et de la nature des gènes potentiellement impliqués dans la CMA chez les poissons. La seconde approche visera à déterminer le rôle physiologique de l'homologue de lamp2a nouvellement identifié chez les poissons. Récemment, nous avons généré (grâce à l'outil d'édition du génome CRISPR-Cas9) une lignée mutante de medaka (Oryzias latipes) dont le variant d'épissage lamp2a du gène lamp2 est spécifiquement invalidée (lignée L2AKO). Dans ce second axe, nous effectuerons donc un phénotypage exhaustif de cette lignée L2AKO à différents niveaux (histologique, biochimique et moléculaire) afin de déterminer les conséquences métaboliques de l’invalidation de lamp2a et ainsi de confirmer l’existence d’une activité CMA fonctionnelle chez le medaka.

Durée : Début de projet le 15/01/2018 pour 36 mois