Comment les organes reproducteurs évoluent est une question fondamentale en biologie car ils jouent un rôle majeur pour le succès de la reproduction et l’évolution des espèces. Cependant, notre compréhension moléculaire de l’évolution des gonades chez les vertébrés est restreinte aux mammifères, et reste limitée du fait de barrières technologiques qui étaient jusqu’à présent insurmontables. Par conséquent, il est communément admis que le testicule est l’organe principal à l’origine des innovations évolutives chez les vertébrés, car il montre une évolution plus rapide chez les mammifères en comparaison aux autres organes incluant l’ovaire. Sur la base de données moléculaires préliminaires et d’observations phénotypiques, nous faisons l’hypothèse que ceci ne serait pas universel et que l’ovaire aurait évolué particulièrement rapidement chez les poissons téléostéens au niveau moléculaire, ce qui en ferait un moteur majeur de l’adaptation évolutive chez la moitié des vertébrés vivant sur terre. Dans ce contexte, l’objectif principal d’Evo-Ovo est d’élucider la diversification cellulaire et moléculaire des organes reproducteurs au cours des 300 millions d’années d’évolution des poissons téléostéens. Pour cela, nous combinerons des techniques multi-omiques de pointe et de nouvelles approches quantitatives que nous développerons. Tout d’abord, nous allons décrypter la plasticité évolutive des génomes de poissons par l’utilisation de la génomique comparée à grande échelle. Puis, nous retracerons l’évolution cellulaire et moléculaire des gonades de poissons par la production et comparaison d’atlas single-cell à partir d’espèces représentatives. Les résultats d’Evo-Ovo seront cruciaux pour décoder l’évolution des espèces, des gonades, et des génomes, sous une nouvelle hypothèse. Ces avancées fondamentales ouvriront la voie à des études appliquées en produisant des connaissances, des ressources, et des méthodes qui seront utiles pour l’agriculture et la médecine en général.