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Les esturgeons constituent un groupe d’espèces naturellement polyploïdes avec des espèces diploïdes, tétraploïdes, hexa ou octoploïdes voire même dodécaploïdes. Les éleveurs français sont pionniers et leaders en matière de production de caviar avec deux espèces principales : l’esturgeon du Danube Acipenser gueldenstaedtii et l’esturgeon Sibérien Acipenser baerii. Le passage à une sélection génomique, en fonction de sa faisabilité, pourrait permettre d’améliorer l’efficacité des schémas de sélection avec des valeurs génétiques plus précises mais aussi en raccourcissant les intervalles entre générations ou en indexant les mâles sur les performances de production ou qualitatives des femelles. Cependant, et à ce jour, la mise en œuvre d’une sélection génomique n’a encore jamais été tentée chez une espèce animale polyploïde et les outils nécessaires n’existent pas encore. Avec le soutien de FranceAgriMer et de l’Union Européenne (FEAMP), et en étroite concertation avec les entreprises de sélection adhérentes au SYSAAF (Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français), l’INRA séquencera le génome d’une deuxième espèce (l’esturgeon du Danube) et l’INRA et le SYSAAF développeront une puce basse densité bi-espèce. L’intérêt de cette puce sera évalué à partir de génotypes et de phénotypes mis à disposition par l’entreprise de sélection Ecloserie de Guyenne en collaboration avec des généticiens du domaine végétal pratiquant déjà ce mode de sélection chez les plantes.

Coordinateur : Yann Guiguen, Laboratoire INRA de Physiologie et de Génomique des Poissons (INRA-LPGP)

Partenaires : 

• UMR INRA 1095 Génétique Diversité et Ecophysiologie des Céréales Clermont-Ferrand (INR-GDEC)
• SIGENAE, INRA Toulouse (INRA-SIGENAE)
• Plateforme MGX - Montpellier GenomiX (MGX),  Montpellier
• Syndicat des Sélectionneurs Avicoles et Aquacoles Français (SYSAAF)